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为减少仓库噪声和重复规则，整理当前开发入口并移除已废弃资料。 - 精简根 AGENTS，补充四个应用规则与 README，统一规范入口 - 归整部署文件、SOP 原稿和参考资源，修正迁移后的脚本路径 - 取消虚拟环境、工具状态、业务导出及备份的跟踪，本机所需原件保留 - 移除停用的 graphify 配置、脚本与产物 - 删除历史业务文档、执行计划、OpenSpec 业务变更和移动 UI 原型 - 清理失效引用，历史细胞产品导入改为必须显式指定 --file 验证：git diff --cached --check、OpenSpec 严格校验、导入参数隔离检查 3/3 通过； 迁移文件完整性和现行链接已核对。未执行部署、业务数据导入或服务启停。
中科兴皖后端
Python 3.9 + FastAPI + SQLAlchemy + Pydantic v2。共享 MySQL 5.7、Redis、MinIO，提供认证、权限、市场协议、存储、生产、质检、中试及 OA 等 API。
结构
app/main.py：应用入口、路由与中间件注册。app/api/：接口；app/schemas/：请求与响应结构（部分旧模块在 API 中定义）。app/services/：业务服务与两套现有流程引擎；app/crud/：数据操作。app/models/：模型；app/core/：认证、配置、数据库与权限。app/tasks/：定时任务；tests/：回归测试；scripts/：检查及一次性运维工具。
规则见 AGENTS，工程关系见根 README。依赖包含 Alembic，但仓库目前没有可直接运行的 Alembic 迁移目录，不能据此假定可执行 alembic upgrade head。
准备环境
以下命令从 backend/ 执行。已有环境无需重复创建或覆盖配置。
python3.9 -m venv venv
venv/bin/python -m pip install -r requirements.txt
venv/bin/python -m pip check
首次配置时复制 .env.example 为 .env，按团队提供的本地环境填写。默认读取 backend/.env；其他环境通过 ENV_FILE 指定。不要提交实际凭据或把测试环境指向生产数据。
虚拟环境由每台机器重建，不纳入 Git。测试工具不是运行依赖；需要 pytest 时安装到开发虚拟环境，再从本目录执行，例如 venv/bin/python -m pytest tests/test_child_row_sync.py。完整测试集需先确认配置及隔离数据环境。
服务命令（由用户执行）
| 环境 | 命令入口 | 默认监听／配置 |
|---|---|---|
| 本地 | ./start.sh --host 127.0.0.1 --port 8000 --reload |
.env，脚本默认 host 原为 0.0.0.0，此处显式绑定本机 |
| 生产 | ./start-prod.sh start |
0.0.0.0:8111、.env.production、venv/ |
| 测试 | ./start-test.sh start |
127.0.0.1:10002、.env.test、.venv/ |
生产／测试脚本另支持 status、stop、restart、logs。Agent 不自行启停或重启服务。不存在 start-local.sh；旧测试端口 8112 不能代替当前脚本默认值。
API 与数据
默认前缀 /api；Web 管理接口主要为 /api/web/...，移动接口主要为 /api/mini/...。公共登录路径以 app/api/public.py 为准。JWT、RSA 登录加密、API 加密和审计由现有中间件与配置控制。
/health 是健康检查；/docs、/redoc 仅在 DEBUG 启用时提供。
SQL 位于 docs/sql。当前初始化基线不完整，部分历史迁移缺失；尚未验证从空库部署。不能直接向现有业务库导入根目录备份或运行清库、重置密码、导入脚本作为验证。
检查
- 运行受影响测试；测试数量随代码变化，不把旧报告视为当前通过证明。
- CRUD 修改从根目录运行
python backend/scripts/check_field_consistency.py，同时人工核对新增或未注册实体；已知覆盖限制见字段一致性指南。 scripts/中的 migration、seed、reset、clear、import 工具可能写库，先读用途和数据范围，不批量执行。